南京航天醫院創建于 1944 年，是一所綜合性的公立二級醫療機構。2018年底醫院響應國家企業醫院醫療機構改革的號召，從原企業晨光集團分離劃入中國航天科工集團公司的二級醫療單位航天醫療健康科技有限公司（簡稱航天醫科），2019年7月12日，航天醫科下文批復同意我院由南京晨光醫院更名為南京航天醫院。南京航天醫院是南京市第一醫院集團單位和醫聯體合作單位、南京醫科大學眼科醫院和南京明基醫院的醫聯體單位，是南京市醫療保險及工傷定點單位。醫院本部位于南京市秦淮區中華門外正學路 1 號，北鄰中華門秦淮河及大報恩寺遺址公園，南鄰風景秀麗的雨花臺及應天高架，交通十分便捷。醫院為園林式建筑風格，整體環境古樸幽雅，占地面積9005 ㎡，建筑面積 8231 ㎡。醫院還設有武定新村分院醫療服務點。